Malgré les digues qui la protégent et les murs qui entourent le clos du lazaret, l'île Tatihou n'est pas à l'abri des vagues et des embruns. L'alternance de rochers, de dunes et de zones herbeuses favorise l'implantation des plantes endémiques du bord de mer mais les coups de vent du large sont autant de périls pour une flore plus fragile. Implanter un jardin était donc un pari difficile à tenir. C'est aujourd'hui chose faite. Tatihou offre ainsi au visiteur trois types de jardins :
- Un jardin des découvertes ou "jardin des milieux"
de petite dimension (800 m), il regroupe plusieurs centaines d'espèces du littoral réparties selon leur milieu (dune, vase salée, rocher, landes, prairie)
- Un grand jardin maritime
sur trois hectares, c'est un lieu de promenade à l'abri des murs mais il est aussi ouvert sur le large. Les plantes endémiques de Manche Atlantique y dominent mais alternent avec certaines espèces horticoles.
- Un jardin d'acclimatation
répartie dans les anciennes cours du lazaret, une série de massifs et de parterres présentent des espèces exotiques mais pourtant assez bien adaptées à la rigueur du climat marin.